Kostel i hřbitov založen při morové epidemii r. 1680. Téhož roku učinil staroměstský magistrát veřejný slib, že na tehdy zřízeném I. hřbitově na Wolšanech zbuduje kapli ke cti morových patronů sv. Rocha, Šebestiána a Rosalie. Kostel byl vysvěcen 27. července 1682. Založení dokládá latinský nápis nad vchodem "S. P. Q. A. U. P. EX VOTO EREXIT ANNO MDCLXXX" (tj. Městská rada a lid Starého Města pražského zbudovali roku 1680). R. 1839 povýšen dekretem gubernia na farní kostel.