Ves Hrutkov leží cca 5 km jihovýchodně od centra města Jindřichův Hradec, ve zvlněné, spoře zalesněné krajině. Jižně od obce je okraj rozlehlého lesnatého masívu Novobystřické vrchoviny (součást Javořické vrchoviny), nazývaného „Česká Kanada“. Hrutkov je typickým příkladem středověkého kolonizačního sídla na Jindřichohradecku. Vesnice byla vysazena na lánovém půdorysu kolem nepravidelné oválné návsi o délce 250 m. Dvě řady usedlostí lemovaly mělkou pramennou pánev, dodatečně vyplněnou rybníčky. Později se ves rozvíjela jen zcela minimálně, až na konci 18. století vznikl blok chalupnické zástavby, který rozdělil prostor návsi do dvou částí. V 19. století některé usedlosti v severní řadě ustoupily z linie návsi dozadu do polí, což je charakteristické pro oblast Jindřichohradecka i Třeboňska; v této době získala obec svoji dominantu v podobě novogotické kaple sv. Josefa. Tím se prostorový vývoj vsi zastavil, pouze ve druhé polovině 20. století vznikly severně od vsi nevelké zemědělské objekty. Převládající zástavba v Hrutkově je klasicistní, vesměs ze dvacátých až čtyřicátých let 19. století. Nejstarší identifikovatelnou stavbou ve vsi je pozdně barokní brána v čp. 15, která pochází asi z přelomu 18. a 19. století.