Rozsáhlý areál kostela se rozkládá na vrchu Velíz nad obcí Kublov zhruba v hranicích prehistorického sídliště a slovanského hradiště. Kostel je situován v JZ areálu na hřbitově, a s bývalou márnici, farou a hospodářským stavením na Z. V sousedství fary se nalézá několik usedlostí, zbytek areálu tvoří louky. Předmětem ochrany je kostel sv. Jana Křtitele, fara, márnice, hospodářská budova, ohradní zeď, středověký klášter-fragment, klášteřiště a pozemky st.p.101/1, 102/1, 102/2, 104, 105, 106, 107, 73, 183, a p.p. 308, 327, 328/1, 328/2, 330, 331, 332/2, 332/3, 333/2, 334/1, 334/2, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 344/2, 345/1, 345/3, 345/4, 731, 732, 733, 757.